En el desafío CanSat los equipos deben construir el CanSat, para que cumpla dos misiones:

• Misión primaria: igual para todos los equipos. Esta misión consiste en medir temperatura y presión atmosférica una vez por segundo mientras cae el CanSat, y recibir los datos en tiempo real a través de un sistema inalámbrico.
• Misión Secundaria: relacionar el satélite CanSat con una misión o experimento científico que justifique su construcción.

La misión secundaria del CanSat debe ser seleccionada por el equipo. Los equipos pueden tomar ideas de misiones satelitales reales o recopilar datos científicos para un proyecto específico, hacer una demostración de tecnología para un componente diseñado por estudiantes o cualquier otra misión que encaje dentro del CanSat y muestre sus capacidades. Los equipos pueden inspirarse en las misiones de la Agencia Espacial Europea para diseñar sus propias misiones secundarias.